恒溫?zé)晒?/span>PCR檢測(cè)儀實(shí)現(xiàn)多重靶標(biāo)同步擴(kuò)增，是基于對(duì)傳統(tǒng) PCR 技術(shù)的優(yōu)化與創(chuàng)新，核心在于在單一反應(yīng)體系中同時(shí)實(shí)現(xiàn)多個(gè)核酸靶標(biāo)的特異性擴(kuò)增與實(shí)時(shí)檢測(cè)。其原理與面臨的挑戰(zhàn)可從以下方面展開：

一、多重靶標(biāo)同步擴(kuò)增的核心原理

恒溫?cái)U(kuò)增體系的適配性

恒溫?zé)晒?/span>PCR檢測(cè)儀擺脫了傳統(tǒng)PCR的溫度循環(huán)依賴，通過特定酶系統(tǒng)（如Bst DNA聚合酶）和引物設(shè)計(jì)，在恒定溫度（通常60-65℃）下實(shí)現(xiàn)核酸的指數(shù)級(jí)擴(kuò)增。對(duì)于多重靶標(biāo)，需為每個(gè)靶標(biāo)設(shè)計(jì)專屬的引物對(duì)，這些引物需具備相似的退火溫度和擴(kuò)增效率，確保在同一恒溫條件下均能高效結(jié)合模板并啟動(dòng)延伸。同時(shí)，恒溫?cái)U(kuò)增中常用的鏈置換反應(yīng)（如LAMP技術(shù)）可通過多對(duì)引物（內(nèi)引物、外引物等）識(shí)別靶標(biāo)序列的不同區(qū)域，為多重?cái)U(kuò)增提供更多的特異性識(shí)別位點(diǎn)。

熒光標(biāo)記的特異性區(qū)分

為實(shí)現(xiàn)不同靶標(biāo)的同步檢測(cè)，需對(duì)每個(gè)靶標(biāo)的擴(kuò)增產(chǎn)物進(jìn)行特異性熒光標(biāo)記。通常采用兩種策略：一是使用不同熒光基團(tuán)標(biāo)記的探針（如TaqMan探針），每種探針僅與特定靶標(biāo)的擴(kuò)增產(chǎn)物互補(bǔ)結(jié)合，當(dāng)探針被酶切降解時(shí)釋放熒光，通過檢測(cè)不同波長(zhǎng)的熒光信號(hào)區(qū)分靶標(biāo)；二是利用熒光染料與特定擴(kuò)增產(chǎn)物的構(gòu)象結(jié)合（如分子信標(biāo)），不同分子信標(biāo)的莖環(huán)結(jié)構(gòu)設(shè)計(jì)對(duì)應(yīng)不同靶標(biāo)，結(jié)合后產(chǎn)生的熒光信號(hào)具有特異性。恒溫?zé)晒?/span>PCR檢測(cè)儀通過多通道熒光檢測(cè)模塊（如4通道、6通道）同時(shí)捕捉不同波長(zhǎng)的熒光，實(shí)現(xiàn)對(duì)多重靶標(biāo)的實(shí)時(shí)監(jiān)測(cè)。

反應(yīng)體系的兼容性優(yōu)化

多重?cái)U(kuò)增需保證各靶標(biāo)反應(yīng)之間無(wú)干擾，這依賴于引物與探針的特異性設(shè)計(jì) —— 避免不同引物對(duì)之間形成交叉二聚體，同時(shí)確保探針僅與目標(biāo)擴(kuò)增產(chǎn)物結(jié)合而不與其他序列反應(yīng)。此外，反應(yīng)體系中的酶濃度、dNTP濃度、Mg2?濃度等需適配所有靶標(biāo)的擴(kuò)增需求，通過優(yōu)化配比減少競(jìng)爭(zhēng)抑制，使各靶標(biāo)在同一體系中均能高效擴(kuò)增。

二、實(shí)現(xiàn)多重靶標(biāo)同步擴(kuò)增的主要挑戰(zhàn)

引物與探針的交叉干擾

多重反應(yīng)中，多對(duì)引物和探針共存易導(dǎo)致非特異性相互作用：例如，不同引物的互補(bǔ)序列可能形成交叉二聚體，消耗反應(yīng)原料并產(chǎn)生非特異性擴(kuò)增；探針可能與非目標(biāo)引物或擴(kuò)增產(chǎn)物結(jié)合，導(dǎo)致熒光信號(hào)假陽(yáng)性，這干擾隨靶標(biāo)數(shù)量增加而顯著加劇，尤其是當(dāng)靶標(biāo)序列同源性較高時(shí)（如同一基因家族的不同成員），設(shè)計(jì)特異性引物和探針的難度極大。

擴(kuò)增效率的不均衡性

不同靶標(biāo)的序列特征（如GC含量、二級(jí)結(jié)構(gòu)）差異會(huì)導(dǎo)致擴(kuò)增效率不同：某些靶標(biāo)可能快速擴(kuò)增，消耗大量反應(yīng)資源，抑制其他靶標(biāo)的擴(kuò)增；而另一些靶標(biāo)可能因引物結(jié)合效率低而擴(kuò)增緩慢，導(dǎo)致信號(hào)強(qiáng)度不足。即使通過體系優(yōu)化，也難以完全消除這種不均衡性，尤其在靶標(biāo)濃度差異較大時(shí)（如高豐度靶標(biāo)與低豐度靶標(biāo)共存），低豐度靶標(biāo)的信號(hào)可能被高豐度靶標(biāo)的信號(hào)掩蓋。

熒光信號(hào)的光譜重疊

熒光基團(tuán)的發(fā)射光譜往往存在部分重疊，例如FAM（綠色熒光）與VIC（橙黃色熒光）的光譜可能交叉。當(dāng)多重檢測(cè)中使用的熒光基團(tuán)數(shù)量增加時(shí)，光譜重疊會(huì)導(dǎo)致信號(hào)串?dāng)_ —— 某一通道檢測(cè)到的熒光可能包含其他通道的干擾信號(hào)，降低檢測(cè)的準(zhǔn)確性。雖然可通過儀器的光學(xué)濾波系統(tǒng)和算法校正減少干擾，但對(duì)于超過4-5重的靶標(biāo)檢測(cè)，仍難以完全避免信號(hào)失真。

靈敏度與特異性的平衡

多重?cái)U(kuò)增中，為減少交叉干擾，常需提高引物和探針的特異性（如增加長(zhǎng)度、優(yōu)化退火溫度），但這可能降低擴(kuò)增效率，導(dǎo)致靈敏度下降，難以檢測(cè)低濃度靶標(biāo)；反之，若為提升靈敏度而降低特異性要求，則易出現(xiàn)非特異性擴(kuò)增，導(dǎo)致假陽(yáng)性，這平衡在臨床樣本檢測(cè)（如病原體多重篩查）中尤為關(guān)鍵，這是因?yàn)闃颖局锌赡艽嬖诖罅繌?fù)雜背景核酸，進(jìn)一步加劇特異性挑戰(zhàn)。

反應(yīng)體系的復(fù)雜性調(diào)控

隨著靶標(biāo)數(shù)量增加，反應(yīng)體系中引物、探針、酶等成分的濃度需精確調(diào)控，任何一種成分的過量或不足都可能影響整體反應(yīng)效率，例如，過多的引物可能導(dǎo)致非特異性結(jié)合，而過少則無(wú)法支持高效擴(kuò)增；酶的活性受溫度、pH等因素影響，在多重反應(yīng)中需同時(shí)適配多個(gè)靶標(biāo)的需求，體系優(yōu)化的工作量呈指數(shù)級(jí)增長(zhǎng)。

三、應(yīng)對(duì)挑戰(zhàn)的關(guān)鍵方向

目前的解決思路主要包括：通過生物信息學(xué)工具（如Primer-BLAST、OligoAnalyzer）優(yōu)化引物和探針設(shè)計(jì)，減少交叉反應(yīng)；開發(fā)高特異性的熒光探針（如鎖核酸探針LNA）增強(qiáng)與靶標(biāo)的結(jié)合特異性；利用數(shù)字恒溫PCR技術(shù)將反應(yīng)體系分散到微滴中，降低不同靶標(biāo)間的競(jìng)爭(zhēng)干擾；以及改進(jìn)儀器的光學(xué)檢測(cè)系統(tǒng)（如超光譜成像）提高熒光信號(hào)的區(qū)分度，這些技術(shù)的進(jìn)步正在逐步突破多重靶標(biāo)同步擴(kuò)增的限制，推動(dòng)其在臨床診斷、環(huán)境監(jiān)測(cè)等領(lǐng)域的廣泛應(yīng)用。

本文來(lái)源于深圳市芬析儀器制造有限公司http://9ao5c9.cn/